Make rotational average with Spider

-- From here we use EMAN / EMAN2


1. Box all particles with EMAN2 (using e2boxer.py)
2. Combine all the particles into one file (using proc2d)
3. Align all particles with X,Y shift (using cenalignint)

無聊的人都會想要留下一點回憶~

雖然自己發表的論文只刊在impact factor非常低的期刊上,
但至少這是第一篇,以回憶文來說,
還是應該把它留下來當紀念...必竟這也是那個月份的封面啊!

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回憶文 XD!

Focal pair alignment methiod

因為 close-to-focus image (<＝ 1 micron) 通常比較不容易box,因為他的對比度非常低,所以如果要收集close-to-focus的data時,會採用focal pair的方式,同一個區域的影像照2次：第一次是take close-to-focus image,第二次是take far-from-focus image。這樣我們就可以在對比度比較高的image上box我們要的particles,再將其

Deep-stain embedded 方法

Materials:
1.Ammonium molybdate
2.Trehalose

Negative stain solution:
1.16% (w/v) Ammonium molybdate or
2.4% (w/v) Ammonium molybdate with 1% (w/v) Trehalose at pH=7.0

轉變...

今天下午在實驗室跟學妹們說,昨天晚上我去拿要申請簽證的大頭照,看到之後自己都嚇了一跳,因為我跟一年前的自己相比...不但變胖又變老 Q.Q看了真的很想哭...不過懿昀比較上道...說我比夏天的時候看起來還

六福村

記得上次去這個地方的時候,那裡只有野生動物園!我跟著爸媽坐在遊園巴士裡面的印象已經非常模糊,一點都不記得看到了什麼東東~!如果不是小眼睛提議要去,我可能都不知道六福村已經進化到還有多種的主題樂園!還好不是元旦那天就去,因為我一睡就睡到中午...也還好小眼睛沒跟我

夏末VS寒冬

直接看照片吧~

瑞典的雪

之前才說今年的瑞典有著暖冬,一直到12月2日才開始結霜,接著沒想到12月12日就開始下起大雪!這場雪來得有點突然,一夕間讓整個斯德哥爾摩變成銀白色的世界,雖然為耶誕節增添了氣氛,卻也為當地的交通帶來極大的困擾!下起雪的瑞典,通聯火車幾乎是天天delay,公車也非常的不準

Happy 2010

又到了一年的尾聲... 回首2009感覺是很充實的一年,尤其前半年我都在部隊裡面度過,謝謝那些照顧我的長官與同梯們,讓我【快快樂樂】的當兵,平平安安的退伍,知道內幕的人就陪我在心裡一起偷笑就好~^Q^ 緊接著是在暑假裡數不完的生日趴、退伍趴、還有又要出國的餞行趴...在不