Make rotational average with Spider

-- From here we use EMAN / EMAN2


1. Box all particles with EMAN2 (using e2boxer.py)
2. Combine all the particles into one file (using proc2d)
3. Align all particles with X,Y shift (using cenalignint)

無聊的人都會想要留下一點回憶~

雖然自己發表的論文只刊在impact factor非常低的期刊上,
但至少這是第一篇,以回憶文來說,
還是應該把它留下來當紀念...必竟這也是那個月份的封面啊!

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回憶文 XD!

Focal pair alignment methiod

因為 close-to-focus image (<＝ 1 micron) 通常比較不容易box,因為他的對比度非常低,所以如果要收集close-to-focus的data時,會採用focal pair的方式,同一個區域的影像照2次：第一次是take close-to-focus image,第二次是take far-from-focus image。這樣我們就可以在對比度比較高的image上box我們要的particles,再將其

Deep-stain embedded 方法

Materials:
1.Ammonium molybdate
2.Trehalose

Negative stain solution:
1.16% (w/v) Ammonium molybdate or
2.4% (w/v) Ammonium molybdate with 1% (w/v) Trehalose at pH=7.0

轉變...

今天下午在實驗室跟學妹們說,昨天晚上我去拿要申請簽證的大頭照,看到之後自己都嚇了一跳,因為我跟一年前的自己相比...不但變胖又變老 Q.Q看了真的很想哭...不過懿昀比較上道...說我比夏天的時候看起來還